Fundado em 1912 como Swansea Town pelo empresário John William Thorpe, o clube estreou em 7 de setembro daquele ano com um empate por 1 a 1 contra o Cardiff City no Vetch Field, gol de Billy Ball. Na própria temporada de estreia já ganhou a Copa do País de Gales e o campeonato galês, e terminou em terceiro lugar na Segunda Divisão da Southern League. Rebatizado Swansea City em 1970, no ano seguinte ao status de cidade conquistado por Swansea, o clube quase não sobreviveu para contar essa história: uma ordem de liquidação em 1985 só não fechou as portas graças ao resgate de cinco empresários locais, apelidados de Famous Five, ao lado de Doug Sharpe, e em 2003 o time evitou por pouco a queda à quinta divisão inglesa, então chamada Conference.
A subida mais rápida da história aconteceu entre 1978 e 1981, quando o galês John Toshack, contratado ainda como jogador do Liverpool, tirou o clube da Quarta Divisão inglesa e o levou à Primeira em quatro temporadas, façanha que só o Wimbledon também cumpriu. O pico veio em 1981-82, sexto lugar na elite, recorde do clube até hoje, com vitórias sobre Leeds United por 5 a 1, Tottenham, Arsenal, Liverpool e Manchester United, e um 12 a 0 sobre o maltês Sliema Wanderers na Recopa Europeia que segue como o maior placar da história do clube. Toshack ainda ganhou três Copas do País de Gales no comando.
A segunda subida à elite veio sob Brendan Rodgers, que bateu o Reading por 4 a 2 na final do playoff de 2011 e fez do Swansea o primeiro time galês a jogar a Premier League desde a fundação da liga, em 1992, um ano depois de Roberto Martínez, o técnico com o maior percentual de vitórias da história do clube, tê-lo levado da League One à Championship como campeão em 2008. O auge veio com o dinamarquês Michael Laudrup: a Copa da Liga de 2013, 5 a 0 sobre o Bradford City na final, o único troféu profissional da história do clube, e a temporada 2014-15, oitavo lugar com 56 pontos, a melhor campanha da história na Premier League, com doubles sobre Arsenal e Manchester United, façanha alcançada por só mais dois times na história da competição.
O rebaixamento veio em maio de 2018, batido pelo Stoke City por 2 a 1, e encerrou sete temporadas seguidas na elite. Desde então o clube troca de comando com frequência tentando voltar pela Championship: Steve Cooper chegou ao playoff duas vezes entre 2019 e 2021 sem subir, e Russell Martin saiu direto para o Southampton em 2023. A propriedade também mudou de mãos, do consórcio americano de Jason Levien e Steven Kaplan, que assumiu o controle em julho de 2016, para um novo grupo que comprou o clube em novembro de 2024 e trouxe como investidores o meio-campista croata Luka Modrić e o rapper americano Snoop Dogg.
Numa carreira, é clube que revela e revende. Joe Allen, Wilfried Bony, André Ayew, Gylfi Sigurðsson e Oli McBurnie saíram todos por cifras recordes, e a base fez o mesmo em escala menor: Daniel James custou 72 mil libras ao Hull City em 2014 e saiu por cerca de 15 milhões ao Manchester United cinco anos depois, e Joe Rodon e Ben Davies venderam a mesma lição ao Tottenham Hotspur, por 11 milhões de libras e dentro do negócio que trouxe Sigurðsson ao clube, respectivamente. É dessa reforma que o Swansea vive desde que perdeu a Premier League.