Este clube veio de um clube de GINÁSTICA fundado em 1886 como Turnerbund Jahn Regensburg, e o nome homenageia FRIEDRICH LUDWIG JAHN, cujas ideias sobre ginástica moldaram o esporte alemão do século XIX. O departamento de futebol nasceu em 1907. Os futebolistas saíram do clube-mãe em 1924, e em 1934 se juntaram ao SV 1889 Regensburg e ao SV 1920 Regensburg para formar o SSV, que até hoje tem departamentos de atletismo, boxe, futsal, ginástica, handebol, KENDÔ e boliche de nove pinos. O futebol se separou de novo em 2000.
A vida do clube é de sobe e desce. Duas temporadas na Gauliga Bayern nos anos 1930, com dois terceiros lugares seguidos em 1938 e 1939 como melhor resultado. Entre o fim da Segunda Guerra e a criação da Bundesliga em 1963, um time ioiô entre a Oberliga Süd e a segunda divisão. No fim dos anos 1990, TRÊS anos na Landesliga Bayern-Mitte, o QUINTO nível. Uma temporada de 2. Bundesliga em 2003-04, dificuldades financeiras e uma FALÊNCIA evitada por pouco em 2005.
A reconstrução foi feita com detalhes decidindo tudo. Depois de cair para a quarta divisão em 2005-06, o clube ganhou a Oberliga Bayern no ano seguinte, e para entrar na nova 3. Liga precisava terminar em décimo ou melhor: terminou em NONO. Em 2011-12 ficou terceiro e subiu à 2. Bundesliga pelo GOL FORA DE CASA, com 1 a 1 em casa e 2 a 2 contra o Karlsruher, oito anos depois da última vez.
Depois disso, ÚLTIMO lugar na 2. Bundesliga em 2012-13, ÚLTIMO na 3. Liga em 2014-15 e rebaixamento à Regionalliga. Em 2015-16 ganhou a Regionalliga Bayern e a repescagem contra o Wolfsburg II por 2 a 1 no agregado; na temporada seguinte ficou terceiro na 3. Liga e subiu de novo, batendo o 1860 MUNIQUE por 3 a 1 no agregado. Foram duas promoções consecutivas sob HEIKO HERRLICH.
Com Achim Beierlorzer e depois Mersad Selimbegović, o clube se firmou na 2. Bundesliga apesar das limitações financeiras, e ficou conhecido pelas viradas (a torcida passou a chamar o time de MENTALITÄTSMONSTER, o monstro de mentalidade. Em 2020-21 chegou às QUARTAS DE FINAL da Copa da Alemanha, a melhor campanha da história. Caiu em 2023 depois de seis anos na segunda divisão, emplacou um recorde de DEZ vitórias seguidas na 3. Liga e voltou pela repescagem em 2024) uma promoção que o time dedicou ao companheiro AGYEMANG DIAWUSIE, morto durante aquela temporada. Joe Enochs, o treinador da subida, foi demitido em outubro de 2024 depois de um 8 a 3 contra o 1. FC Nürnberg. Em 2024-25 o clube caiu outra vez.