O clube nasceu como agremiação de ginástica em 1º de julho de 1899, o Turnverein Hoffenheim, e só virou clube de futebol em 1945, na fusão com o Fußballverein Hoffenheim, fundado em 1921. No começo dos anos 1990 ele jogava a OITAVA divisão do futebol alemão, a A-Liga de Baden-Württemberg, num vilarejo de pouco mais de três mil habitantes. Em 2000 estava na quinta divisão.
O que aconteceu depois disso tem nome próprio: Dietmar Hopp, cofundador da SAP e um dos homens mais ricos da Alemanha, que jogou nas categorias de base deste clube quando menino. A partir de 1990 ele passou a financiar a subida, e o time atravessou cinco divisões em dezoito anos. Em 2008 o Hoffenheim foi promovido à Bundesliga, e desde então nunca mais caiu.
O clube NUNCA ganhou um troféu de peso. A sala tem quatro Copas de Baden, a última em 2005, e nada mais. O melhor resultado é o TERCEIRO lugar de 2017-18, que levou o time à fase de grupos da Liga dos Campeões pela primeira e única vez. Aquele time era dirigido por Julian Nagelsmann, que assumiu aos 28 anos e virou o técnico mais jovem da história da Bundesliga.
A ascensão financiada é também a razão pela qual o clube é o mais impopular da Alemanha ao lado do RB Leipzig. Ele cumpre a regra dos 50 mais 1 por uma exceção concedida a quem investe num clube por mais de vinte anos, e as arquibancadas de meio país trataram isso como fraude, em 2020 uma sequência de faixas ofensivas contra Dietmar Hopp em vários estádios levou jogadores a parar partidas em protesto. É um clube que ganhou lugar na elite e não ganhou aceitação.
Desde 2009 a casa é a PreZero Arena, em Sinsheim, com 30.150 lugares, e antes dela o time jogava no Dietmar-Hopp-Stadion, construído em 1999. O que sustenta o clube hoje é a venda: as dez maiores vendas da história somam mais de 320 milhões de euros, com Bazoumana Touré por 50 milhões ao Newcastle em 2026, Joelinton por 43,5 ao mesmo Newcastle em 2019, Roberto Firmino por 41 ao Liverpool em 2015 e Georginio Rutter por 40,5 ao Leeds em 2022. A maior compra da história são 18,5 milhões.