O futebol em Girona começou com o Strong Esport, fundado em 1902 com o nome FC Gerundense, e dois dos primeiros jogadores dele, Narciso Callicó e Salvador Hormeu, acabaram no FC BARCELONA. Nos anos 1920 o Unió Deportiva Girona virou o time mais forte da cidade, mas desapareceu em 1929 com uma dívida de duzentas mil pesetas, uma fortuna para a época.
Este clube nasceu em 23 de julho de 1930, no café Norat, na Rambla de Girona, exatamente da dissolução daquele. Em 1º de agosto a prefeitura autorizou o uso do escudo da cidade no brasão, graças ao esforço de entusiastas liderados pelo primeiro presidente, Albert de Quintana de León. A primeira partida oficial foi contra o Colònia Artigas.
A primeira temporada de segunda divisão foi 1935-36, com o clube terminando em primeiro do grupo e caindo no playoff contra Celta, Zaragoza, Arenas, Murcia e Xerez. Depois da Guerra Civil vieram décadas de queda: terceira divisão em 1959, quarta em 1980, e até TRÊS temporadas nos campeonatos regionais, em 1982-83 e entre 1997 e 1999.
O Montilivi começou a ser construído em 1968 e virou casa permanente em 1970, depois de quase cinco décadas no Vista Alegre. Em 16 de junho de 2008, com um 1 a 0 sobre o Ceuta no playoff, o time de Raül Agné conseguiu a segunda promoção consecutiva e voltou à segunda divisão depois de QUARENTA E NOVE anos de ausência.
Em 22 de julho de 2010 um grupo de empresários locais liderado por Ramon Vilaró, Joaquim Boadas e Josep Slim comprou 72% das ações. Hoje o clube pertence ao CITY FOOTBALL GROUP, o mesmo dono do Manchester City, e os números mudaram de escala: Artem Dovbyk foi vendido à ROMA por 41,1 MILHÕES de euros em 2024, Ladislav Krejci ao Wolverhampton por 22,5 e Miguel Gutiérrez ao NAPOLI por 20. O clube caiu de LaLiga depois de 2025-26.